PHPMyAdmin!

phpMyAdmin es una herramienta libre escrita en PHP con la intención de manejar la administración de MySQL a través de páginas web, utilizando Internet.
Para tener phpMyAdmin, podemos instalar el paquete phpmyadmin de los repositorios oficiales de Ubuntu.

sudo aptitude install phpmyadmin

En las versiones más recientes de Ubuntu el código a utilizar es:

sudo apt-get install phpmyadmin

Después de instalarlo hay que hacer un enlace simbólico desde /usr/share/phpmyadmin hacia /var/www/phpmyadmin sudo ln -s /usr/share/phpmyadmin /var/www/

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Desde la página oficial

Si queremos tener la última versión estable, tendremos que descargar el archivo del sitio web oficial.

1. Descomprimir dentro del directorio del Apache por ejemplo: /var/www/pma
2. Copiar el archivo de configuración que se provee por defecto "config.sample.inc.php" como "config.inc.php".
3. Editarlo y ponerle los valores correspondientes con tu MySQL.

Ejemplo con Autenticación x cookies:

<?php

$cfg['blowfish_secret'] = 'aca_algo_cualquiera';
/*
 * Servers configuration
 */
$i = 0;

/*
 * First server
 */
$i++;
/* Authentication type */
$cfg['Servers'][$i]['auth_type'] = 'cookie';
/* Server parameters */
$cfg['Servers'][$i]['host'] = 'localhost';
$cfg['Servers'][$i]['connect_type'] = 'tcp';
$cfg['Servers'][$i]['compress'] = false;
/* Select mysqli if your server has it */
$cfg['Servers'][$i]['extension'] = 'mysqli'; //mysqli es mas performante puede utilizarse en su defecto mysql  

$cfg['UploadDir'] = '/upload/'; 
$cfg['SaveDir'] = '/download/';

?>